关于桓胤的生平和家族背景，据记载，他出生在东晋时期，字茂远，谯国龙亢（今安徽怀远县龙亢集）人。他的祖父是东晋车骑将军桓冲，因此桓胤也是桓氏子弟，被爱慕者誉为高尚节操的人物，与当时其他两位杰出的王谧和王绥齐名。他继承了父亲的爵位丰城县公，并且以恬静谦退见称。
桓胤从秘书丞开始，一直升迁至中书郎、秘书监。他因受到堂叔父桓玄的钦敬与疼爱，在元兴二年被任命为中书令，同时还担任吏部尚书。但随着刘裕举兵讨伐桓玄后，桓胤跟随其兄长逃走，最终在五月败死后才向晋廷归降。在义熙元年，由于他忠于晋室的大哥之故，即使整个家族不受赦免，他也得到了特许免死，只是流放到新安郡。
然而，在义熙三年，因为殷仲文等人的谋反案件而被指控阴谋拥立继承者的身份遭杀害。他的家族系谱可以追溯到多代，其中包括楚宣武帝桓温，以及其他诸多著名人物，他们对中国历史有着重要影响。
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