1644年，李自成攻入北京，其势力遍布鲁豫、荆楚、秦陇和燕晋。南明仅控制江淮、江南及西南大部分地区。张献忠在四川领导农民军，准备进攻成都。此时的局势如同元朝遗韵，流转于历史长河。
1644年四月二十二日，大顺军被吴三桂和秦军击败。清军占领北京后出兵追击，最终十月初三占领太原。当李自成战败，山东河南明朝官绅纷起义，大顺政权迅速瓦解。而清军乘虚而入至十一月，将畿南、山东和河南北部三镇招抚。
张献忠称帝建立大西政权，而此时的南明疆域进一步缩小。在1650年的十一月，清军平定了陕北的反叛，并且在广州城下围困达数月之久。但郑成功趁机引兵攻击潮州，从而将其与清朝隔绝。
随着时间的推移，不少地方反抗复明，如姜镶在山西、王永强在陕西榆林起事，但最终均未能改变国家命运。这场战争如同一场不眠夜，一波接一波，无休无止地影响着中国的大地。
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