政治腐败与中央集权的衰弱
元朝自建立以来，政治制度主要是采取了大汗和臣子之间的分权制。最初，蒙古族草原上的游牧部落社会相对民主、平等，但随着征服中亚地区后逐渐形成了一个更为中央集权的国家。在这个过程中，由于长期战争带来的财富积累，以及对外扩张所需的人口流动，使得政府机构变得庞大，而官员们则利用手中的权力进行私欲满足，从而导致了政治体系内部出现严重的问题。特别是在忽必烈统治时期，他为了巩固自己的统治地位，进一步加强中央集权，这种高压政体限制了地方贵族和商人的自由活动，最终导致整个社会结构变得僵硬。
经济基础的破坏与资源过度开采
元朝经济上有很大的发展，但同时也伴随着一些问题，如资源过度开采、土地退化等。由于不断的战争和人口增加，耕地不足以养活人群，因此不得不在山区或沙漠地带进行农业生产，这种非传统农业方式极大地破坏了自然环境。此外，对矿产资源如煤炭、铁矿石等的大量开采，也使得这些宝贵资源迅速枯竭，加剧了经济困境。而且，由于缺乏有效管理措施，大量人口流入城市，以至于城市面临食物供应不足的问题。
社会矛盾激化与民族关系紧张
元朝在多个民族融合的情况下，不同民族之间存在较大的文化差异和利益冲突。汉族作为被征服者，其文化被视为低贱，同时汉人受到了一系列苛刻政策如“杀狗肉”、“剥夺婚姻自由”等，这些都加剧了汉族人民对于蒙古人的反感，并促成了反抗运动。在这样的背景下，一些起义如红巾军起义爆发，它们虽然最终失败，但是却暴露出了社会矛盾尖锐化的一面。
军事疲惫与边疆防御能力减弱
长时间的战乱消耗国力，同时边疆防御任务繁重，加之民众对战争厌倦的情绪日益浓厚，使得元军战斗力持续下降。在南宋时期，即便是明智英勇的忽必烈也难以改变局势。他曾亲征南宋，却因病返回，此举实际上证明了一场漫长战争即将结束，而且自己身处前线又无从调兵调将，更是显示出当时军事指挥系统已经非常混乱。
文化隔阂与思想封闭
元代官方推崇的是一种混合文化，其中包括儒家思想、佛教以及伊斯兰教。这一多元文化背景下，上层阶级采用文言文进行行政工作，而普通百姓则主要使用白话文。这造成了一定的沟通障碍。当时官方还非常注重道德规范，出版物要经过严格审查，有关历史记载往往被篡改或删除，从而失去了真实记录历史事件的手段。此外，对待新知识、新技术持保守态度，将科技创新受阻。
